关于鱼菜共生的一个普遍误解是它是一个完整的生态系统。尽管它具有高度可持续性，但大多数商业鱼菜共生系统都需要补充营养才能成功。鼓励种植者在其水源中补充螯合的铁，碳酸钙或碳酸钾和一些微量营养素，以控制pH值。新型高密度养鱼此外，鱼会产生大量的氨，当氨含量过高时，氨会致命。每周使用测试套件检查氨水平，以确保水中的氨含量低而硝酸盐含量高。高密度养鱼技术水箱中过量的氨应稀释，除去或转化。然后，养殖者应力争保持高水平的溶解氧以避免生病的鱼。氧气罐和气泵将保持溶解氧水平升高并防止海湾出没。

鱼菜共生系统的初学者，一般难以控制水的质量，养鱼容易死，因为很多鱼菜共生的初学者不懂分辨鱼菜系统的各种参数，而根据不同参数饲养不同的鱼似乎也很难。因此，我们建议，鱼菜系统初学者可以饲养红色罗非鱼。新型高密度养鱼其体色纯红，型似真鲷，体腔无黑膜，肉质鲜嫩，且生长快，产量高，效益好。红色罗非鱼对盐度和温度的适应范围广。高密度养鱼技术除了可以食用外，由于其体色鲜艳，也很具观赏性。养殖不需要太多的技巧，特别是在夏天，鱼菜系统放置于阳台或楼顶，水温容易升高，红色罗非鱼耐高温，耐低氧。

鱼菜共生的基本原理是水产养殖的水经过初步过滤后，被输送到植物栽培系统，由栽培系统中的硝化细菌将水中的氨氮分解及亚硝酸盐分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。新型高密度养鱼而植物根系又有很强的吸收和过滤能力，水流过植物栽培系统后就相当于经过了净化，再流回水产养殖系统，这样形成一个共生的循环，只用向水产养殖系统定期定量投放饲料，高密度养鱼技术定期补充蒸发消耗的水分，整改系统就能长期稳定的运行下去，从而实现“种菜不施肥，养鱼不换水”，种养健康无公害。

鱼菜共生技术是一项涉及到微生物、植物、鱼三者共营共生的技术，利用三者间的生态关系实现能量物质间的可循环可持续动态发展，达到一种仿自然生态而胜于自然的生态的人工系统鱼菜共生是在无土环境中建立鱼、蔬菜、微生物的循环系统。新型高密度养鱼鱼透过排泄物为植物提供营养，植物吸收养分实现水质过滤，而微生物对鱼排泄物进行分解，为植物提供养分。高密度养鱼技术因此，可以实现“养鱼不换水而无水质忧患，种菜不施肥而正常成长”，达成鱼菜的协同共生。鱼菜共生是再循环系统中植物高的效率栽培的一种“清洁环保”方式。鱼菜共生系统小到居家系统, 大到数万平方的商业化生产系统都适用。