在栽培部分，主要的技术模式有以下几种:1、基质栽培:蔬菜种植在如砾石或者陶粒等基质中。基质起到生化过滤和固态肥料过滤的作用。硝化细菌生长在基质表面，具体负责生化过滤和固态肥料过滤。这种方式适合种植各类蔬菜。2、深水浮筏栽培:蔬菜种植于水槽上，通过泡沫等漂浮材料将其托起。蔬菜的根向下通过浮筏的孔延伸到水中吸收养分。新型植物工厂这种方式比较适用于叶类蔬菜。3、营养膜管道栽培: 通常采用PVC管作为种植载体，营养丰富的水被抽到PVC管道中。植物工厂技术植物通过定植篮的固定，种植于PVC管道上方的开口内，让自己的根访问水分和吸收营养。这种方式主要用于叶类蔬菜。4、气雾栽培:直接将养鱼的水雾化后喷洒到植物的根系，以达到营养吸收的目的。这种方式也主要用于叶类蔬菜，在喷雾之前需要对水进行充分过滤净化，以免堵塞喷雾装置。

1、潮汐灌溉具有节水，封闭的系统循环，可以达到 90%以上的水肥利用率；2、潮汐灌溉作物生长迅速，与传统育苗方式相比，每周至少提早1天，提高了设施利用率；3、潮汐灌溉方式避免了植物叶面产生水膜，使叶片接受更多的光照和光合作用，促使蒸腾从根部吸收更多的养分；新型植物工厂4、潮汐灌溉采用根部基质，可提供稳定的根部水分，避免因靠近根部边缘和根部的干旱而导致毛细根死亡；植物工厂技术5、潮汐灌溉采用人工操作，可轻松控制湿度，保持作物叶面干燥，减少化学药剂的使用；6、潮汐灌溉栽培床下非常干燥，无杂草生长，可减少菌类滋生，甚至通过人工操作来管理营养液，可实现20-30 min内的简单管理。

养鱼和种菜原本是两项分离的农业技术，可能受到了“稻花鱼”（稻田养鱼）的启示，逐渐将两项技术融合为一。形成了鱼和菜共同促成的效果，同时更重要的是，它是一项综合效益很高的纯有机耕作模式——“种菜不施肥，养鱼不换水”。新型植物工厂前国内专门从事鱼菜共生研究和市场开发的公司还不多，其实鱼菜共生是一项涉及到微生物、植物、鱼三者共营共生的技术，植物工厂技术利用三者间的生态关系实现能量物质间的可循环可持续动态发展，达到一种仿自然生态而胜于自然的生态的人工系统，主要的是要考虑这样一个系统的平衡。

国内专注鱼菜共生领域的农业公司还不多。很多农场只是把鱼菜共生作为三产概念引入农场，并没有实际采用鱼菜共生技术进行大规模栽培和向市场供应蔬菜和水产。新型植物工厂耕作体系模式:1、闭锁循环模式:养殖池排放的水经由硝化床微生物处理后，以循环的方式进入蔬菜栽培系统，经由蔬菜根系的生物吸收过滤后，又把处理后的废水返回至养殖池，形成一个闭路循环。植物工厂技术2、开环模式:由养殖池排放的废水作为一次性灌溉用水直接供应蔬菜种植系统而不形成返还回流，每次只对养殖池补充新水。在水源充足的地方可以采用该模式。

关于鱼菜共生的一个普遍误解是它是一个完整的生态系统。尽管它具有高度可持续性，但大多数商业鱼菜共生系统都需要补充营养才能成功。鼓励种植者在其水源中补充螯合的铁，碳酸钙或碳酸钾和一些微量营养素，以控制pH值。新型植物工厂此外，鱼会产生大量的氨，当氨含量过高时，氨会致命。每周使用测试套件检查氨水平，以确保水中的氨含量低而硝酸盐含量高。植物工厂技术水箱中过量的氨应稀释，除去或转化。然后，养殖者应力争保持高水平的溶解氧以避免生病的鱼。氧气罐和气泵将保持溶解氧水平升高并防止海湾出没。

作为养殖渔业，该模式被许多渔业产业化龙头企业运用。按照国家制定的有关标准和要求，该模式生产的出来的水产品大都属于绿色水产品和有机蔬菜，它突出的是产品品质和特性，都是地理标志产品特点，是水产品中的珍品，获得消费者青睐，而且还能给生产者带来大的回报。新型植物工厂该类企业实施的品牌发展战略，它按照公司+渔农户这一产业化模式组织生产，为辐射带动更多的渔农户发展鱼菜共生，它们先在其养殖基地办点示范，诸如优选场地，植物工厂技术营造生产设施，优选养殖鱼类和栽培蔬菜品种，制定养殖技术标准和生产流程，在经济效益导向下，许多渔农户也尝试运用该模式发展渔业和蔬菜生产。目前，该类模式占60%。