关于鱼菜共生的一个普遍误解是它是一个完整的生态系统。尽管它具有高度可持续性，但大多数商业鱼菜共生系统都需要补充营养才能成功。鼓励种植者在其水源中补充螯合的铁，碳酸钙或碳酸钾和一些微量营养素，以控制pH值。新型蔬菜温室大棚此外，鱼会产生大量的氨，当氨含量过高时，氨会致命。每周使用测试套件检查氨水平，以确保水中的氨含量低而硝酸盐含量高。蔬菜温室大棚系统水箱中过量的氨应稀释，除去或转化。然后，养殖者应力争保持高水平的溶解氧以避免生病的鱼。氧气罐和气泵将保持溶解氧水平升高并防止海湾出没。

鱼菜共生是一种新型的复合耕作体系，它把水产养殖与水耕栽培这两种原本都不同的农耕技术，通过巧妙的生态设计，达到科学的协同共生，从而实现养鱼不换水而无水质忧患，种菜不施肥而正常成长的生态共生效应。新型蔬菜温室大棚在传统的水产养殖中，随着鱼的排泄物积累，水体的氨氮增加，毒性逐步增大。而在鱼菜共生系统中，水产养殖的水被输送到水培栽培系统，由细菌将水中的氨氮分解成亚硝酸盐然后被硝化细菌分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。蔬菜温室大棚系统鱼菜共生让动物、植物、微生物三者之间达到一种和谐的生态平衡关系，是可持续循环型零排放的低碳生产模式，也是有效解决农业生态危机的有效方法。

目前的普通蔬菜，农药残留、催熟剂等各种食品安全问题受到越来越多市民的关注。“水培蔬菜”的出现，无疑可以让人们吃到放心的蔬菜。与普通蔬菜相比，水培蔬菜的营养构成更加均衡。相关资料显示，水培蔬菜中提供的营养液是由水和营养元素构成的。新型蔬菜温室大棚营养元素来自可溶解的无机肥料，此类无机肥料与植物在土壤中生长所需要的养分由同样的分子组成。蔬菜温室大棚系统水培法种植可以对蔬菜的营养成分实施准确控制。在收获时，工作人员对上市蔬菜的包装可保护菜叶不被碰碎和损坏，使消费者买到的蔬菜十分新鲜。

要想自己的鱼菜共生蓬勃发展，请遵循以下三个规则：不要忽视虫子，保持鱼缸健康，保持高质量的水。尽管水培作物不太可能遭受害虫侵害，但它们对于蚜虫，红蜘蛛和苍蝇是一个例外，有的种植户还专门从苗圃购买幼苗。在某些情况下，有害昆虫甚至可以作为额外蛋白质的来源直接喂给鱼。新型蔬菜温室大棚也有各种各样的有机和化学喷雾剂，它们也可以消除鱼菜共生系统中的有害虫子。炎热的夏季会导致水温飙升，失去pH值并可能危害鱼类。空调或风扇可以帮助维持鱼类所需的温度。蔬菜温室大棚系统水生植物种植者还须平衡鱼与植物的比例，因为太多的鱼会导致鱼和植物活不下去。其次，鱼缸应始终易于取用。养殖者通常在鱼缸顶部安装生长床以节省空间，但这会使观察鱼缸内部的状况，换水和捕捞鱼变得困难。确保鱼缸和生长通道的布局合理，便于定期观察鱼并与鱼互动。

鱼菜共生是一种新型的种养一体循环农业模式,鱼菜共生对消费者有吸引力的地方有三点:这一种种植方式可自证清白。因为鱼菜共生系统中有鱼存在，任何农药都不能使用，稍有不慎会造成鱼和有益微生物种群的死亡和系统的崩溃。新型蔬菜温室大棚鱼菜共生脱离土壤栽培，避免了土壤的重金属污染，因此鱼菜共生系统蔬菜和水产品的重金属残留都远低于传统土壤栽培。蔬菜温室大棚系统第三鱼菜共生系统蔬菜有特有的水生根系，如果鱼菜共生农场带着根配送的话，消费者很容易识别蔬菜的来源，避免消费者产生这个菜是不是来自批发市场的疑虑。