鱼菜共生的基本原理是水产养殖的水经过初步过滤后，被输送到植物栽培系统，由栽培系统中的硝化细菌将水中的氨氮分解及亚硝酸盐分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。新型水培蔬菜种植而植物根系又有很强的吸收和过滤能力，水流过植物栽培系统后就相当于经过了净化，再流回水产养殖系统，这样形成一个共生的循环，只用向水产养殖系统定期定量投放饲料，水培蔬菜种植系统定期补充蒸发消耗的水分，整改系统就能长期稳定的运行下去，从而实现“种菜不施肥，养鱼不换水”，种养健康无公害。

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水肥一体化就是先将肥料兑水溶解，再加入管道灌溉系统，在灌溉的同时将肥料输送到作物根部，适时适量满足作物水肥需求的一种现代农业新技术。新型水培蔬菜种植通俗地讲，水肥一体化就是作物的根在哪里，就将管道通到哪里，水和肥就送到哪里。水肥一体化实现了七个转变：渠道输水向管道输水转变；被动灌溉向主动灌溉转变；水培蔬菜种植系统浇地向浇庄稼转变；土壤施肥向作物施肥转变；水肥分开向水肥一体转变；单一管理向综合管理转变；传统农业向现代农业转变。有专家指出：水肥一体化是发展现代农业的重大技术，更是建设资源节约、环境友好现代农业的“一号技术”，堪称“农业生产方式的革命”。