关于鱼菜共生的一个普遍误解是它是一个完整的生态系统。尽管它具有高度可持续性，但大多数商业鱼菜共生系统都需要补充营养才能成功。鼓励种植者在其水源中补充螯合的铁，碳酸钙或碳酸钾和一些微量营养素，以控制pH值。新型植物工厂此外，鱼会产生大量的氨，当氨含量过高时，氨会致命。每周使用测试套件检查氨水平，以确保水中的氨含量低而硝酸盐含量高。植物工厂技术水箱中过量的氨应稀释，除去或转化。然后，养殖者应力争保持高水平的溶解氧以避免生病的鱼。氧气罐和气泵将保持溶解氧水平升高并防止海湾出没。

鱼菜共生的基本原理是水产养殖的水经过初步过滤后，被输送到植物栽培系统，由栽培系统中的硝化细菌将水中的氨氮分解及亚硝酸盐分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。新型植物工厂而植物根系又有很强的吸收和过滤能力，水流过植物栽培系统后就相当于经过了净化，再流回水产养殖系统，这样形成一个共生的循环，只用向水产养殖系统定期定量投放饲料，植物工厂技术定期补充蒸发消耗的水分，整改系统就能长期稳定的运行下去，从而实现“种菜不施肥，养鱼不换水”，种养健康无公害。

现代渔业是由捕捞、养殖、加工与增殖、休闲五大细分产业构成，其中休闲渔业是由休闲垂钓、观赏性养殖和导向性旅游组成，它是渔业的高业态，新型植物工厂是渔业发展的增长点和渔农增收点，而种植型养殖模式除了渔业生产功能之外还具有资源增殖和环境再造等价值，其高点是鱼菜共生，植物工厂技术这就让休闲渔业龙头企业、专业户和爱好者在营造垂钓场、观赏鱼养殖场和休闲渔业主题公园时运用了鱼菜共生这一模式发展休闲渔业，例如家居搞人工造景，营造微型生态，公园搞生态种养，绿化、美化环境。

它有别于传统的水产养殖，不存在水污染，所以不需要经常大范围地换水。系统本身是一个闭环的生产系统，系统中的水除了蒸发之外，不存在别的耗损情况。又因为水在整个系统中形成了自循环，不需要一直更换水，水的利用率达到了 90%以上。新型植物工厂养鱼池在大棚中，白天水池可以蓄积来自太阳光的能量，晚间释放出来。所以，鱼菜共生大棚中，白天比普通大棚凉爽，晚上又比普通大棚温暖，形成了一个微型的海洋性气候，节约大量加温大棚所需的能源，节约了大量电力消耗。植物工厂技术鱼菜共生系统的建立，可以大大缓解用地困境，因为整个的生产过程对土地的依赖非常小，不需要占用过多的土地，节约用地，同时，也可以避免很多的土生病。因此，鱼菜共生系统是一个节水、节电和节约土地的生产系统。

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生态餐厅是近几年发展起来的一个新兴产业，然而目前国内大部分生态餐厅都处在行业发展的初期，对生态餐厅内涵的理解还比较模糊，部分餐厅仅仅停留在概念炒作的层面上，与传统餐厅不同之处仅仅是建在温室内，多了一些景观植物而已。新型植物工厂生态温室餐厅是将现代设施农业和绿色餐饮结合的产物，以人为本、餐饮为主、景观为为辅的一种大型温室类建筑，把温室的轻巧、便捷、明朗的特点与建筑的多功能性融为一体，植物工厂技术餐厅有充满绿色的自然环境，把大自然丰富多彩的生态景观“微缩化”和“艺术化”。