氮素主要以硝酸盐的形式供应给水培植物，通过细菌硝化作用从鱼类废物的氨转化而来。 其他一些营养物质溶解在鱼废弃物中的水中，但大多数营养物质仍处于植物无法获得的固态。 固体鱼废物被异养细菌分解; 这一行动将必需的营养物质释放到水中。 新型植物工厂确保植物不遭受缺陷的好方法是保持好的水体pH值（6-7）并为鱼类提供平衡和完整的食物，并利用饲料比率来平衡鱼类对植物的摄食量。植物工厂厂家然而，随着时间的推移，即使是平衡的水培养系统也可能缺乏某些营养素，常见的是铁钾或钙。这些营养素的缺乏是鱼饲料成分的结果。

鱼菜共生系统的初学者，一般难以控制水的质量，养鱼容易死，因为很多鱼菜共生的初学者不懂分辨鱼菜系统的各种参数，而根据不同参数饲养不同的鱼似乎也很难。因此，我们建议，鱼菜系统初学者可以饲养红色罗非鱼。新型植物工厂其体色纯红，型似真鲷，体腔无黑膜，肉质鲜嫩，且生长快，产量高，效益好。红色罗非鱼对盐度和温度的适应范围广。植物工厂厂家除了可以食用外，由于其体色鲜艳，也很具观赏性。养殖不需要太多的技巧，特别是在夏天，鱼菜系统放置于阳台或楼顶，水温容易升高，红色罗非鱼耐高温，耐低氧。

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