鱼菜共生系统的初学者，一般难以控制水的质量，养鱼容易死，因为很多鱼菜共生的初学者不懂分辨鱼菜系统的各种参数，而根据不同参数饲养不同的鱼似乎也很难。因此，我们建议，鱼菜系统初学者可以饲养红色罗非鱼。新型植物工厂其体色纯红，型似真鲷，体腔无黑膜，肉质鲜嫩，且生长快，产量高，效益好。红色罗非鱼对盐度和温度的适应范围广。植物工厂技术除了可以食用外，由于其体色鲜艳，也很具观赏性。养殖不需要太多的技巧，特别是在夏天，鱼菜系统放置于阳台或楼顶，水温容易升高，红色罗非鱼耐高温，耐低氧。

氮素主要以硝酸盐的形式供应给水培植物，通过细菌硝化作用从鱼类废物的氨转化而来。 其他一些营养物质溶解在鱼废弃物中的水中，但大多数营养物质仍处于植物无法获得的固态。 固体鱼废物被异养细菌分解; 这一行动将必需的营养物质释放到水中。 新型植物工厂确保植物不遭受缺陷的好方法是保持好的水体pH值（6-7）并为鱼类提供平衡和完整的食物，并利用饲料比率来平衡鱼类对植物的摄食量。植物工厂技术然而，随着时间的推移，即使是平衡的水培养系统也可能缺乏某些营养素，常见的是铁钾或钙。这些营养素的缺乏是鱼饲料成分的结果。

鱼菜共生是一种新型的种养一体循环农业模式,鱼菜共生对消费者有吸引力的地方有三点:这一种种植方式可自证清白。因为鱼菜共生系统中有鱼存在，任何农药都不能使用，稍有不慎会造成鱼和有益微生物种群的死亡和系统的崩溃。新型植物工厂鱼菜共生脱离土壤栽培，避免了土壤的重金属污染，因此鱼菜共生系统蔬菜和水产品的重金属残留都远低于传统土壤栽培。植物工厂技术第三鱼菜共生系统蔬菜有特有的水生根系，如果鱼菜共生农场带着根配送的话，消费者很容易识别蔬菜的来源，避免消费者产生这个菜是不是来自批发市场的疑虑。

鱼菜共生技术是一项涉及到微生物、植物、鱼三者共营共生的技术，利用三者间的生态关系实现能量物质间的可循环可持续动态发展，达到一种仿自然生态而胜于自然的生态的人工系统鱼菜共生是在无土环境中建立鱼、蔬菜、微生物的循环系统。新型植物工厂鱼透过排泄物为植物提供营养，植物吸收养分实现水质过滤，而微生物对鱼排泄物进行分解，为植物提供养分。植物工厂技术因此，可以实现“养鱼不换水而无水质忧患，种菜不施肥而正常成长”，达成鱼菜的协同共生。鱼菜共生是再循环系统中植物高的效率栽培的一种“清洁环保”方式。鱼菜共生系统小到居家系统, 大到数万平方的商业化生产系统都适用。