鱼菜共生的基本原理是水产养殖的水经过初步过滤后，被输送到植物栽培系统，由栽培系统中的硝化细菌将水中的氨氮分解及亚硝酸盐分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。新型室内高密度养鱼而植物根系又有很强的吸收和过滤能力，水流过植物栽培系统后就相当于经过了净化，再流回水产养殖系统，这样形成一个共生的循环，只用向水产养殖系统定期定量投放饲料，室内高密度养鱼系统定期补充蒸发消耗的水分，整改系统就能长期稳定的运行下去，从而实现“种菜不施肥，养鱼不换水”，种养健康无公害。

国内专注鱼菜共生领域的农业公司还不多。很多农场只是把鱼菜共生作为三产概念引入农场，并没有实际采用鱼菜共生技术进行大规模栽培和向市场供应蔬菜和水产。新型室内高密度养鱼耕作体系模式:1、闭锁循环模式:养殖池排放的水经由硝化床微生物处理后，以循环的方式进入蔬菜栽培系统，经由蔬菜根系的生物吸收过滤后，又把处理后的废水返回至养殖池，形成一个闭路循环。室内高密度养鱼系统2、开环模式:由养殖池排放的废水作为一次性灌溉用水直接供应蔬菜种植系统而不形成返还回流，每次只对养殖池补充新水。在水源充足的地方可以采用该模式。

鱼菜共生是一种新型的种养一体循环农业模式,鱼菜共生对消费者有吸引力的地方有三点:这一种种植方式可自证清白。因为鱼菜共生系统中有鱼存在，任何农药都不能使用，稍有不慎会造成鱼和有益微生物种群的死亡和系统的崩溃。新型室内高密度养鱼鱼菜共生脱离土壤栽培，避免了土壤的重金属污染，因此鱼菜共生系统蔬菜和水产品的重金属残留都远低于传统土壤栽培。室内高密度养鱼系统第三鱼菜共生系统蔬菜有特有的水生根系，如果鱼菜共生农场带着根配送的话，消费者很容易识别蔬菜的来源，避免消费者产生这个菜是不是来自批发市场的疑虑。

现代渔业是由捕捞、养殖、加工与增殖、休闲五大细分产业构成，其中休闲渔业是由休闲垂钓、观赏性养殖和导向性旅游组成，它是渔业的高业态，新型室内高密度养鱼是渔业发展的增长点和渔农增收点，而种植型养殖模式除了渔业生产功能之外还具有资源增殖和环境再造等价值，其高点是鱼菜共生，室内高密度养鱼系统这就让休闲渔业龙头企业、专业户和爱好者在营造垂钓场、观赏鱼养殖场和休闲渔业主题公园时运用了鱼菜共生这一模式发展休闲渔业，例如家居搞人工造景，营造微型生态，公园搞生态种养，绿化、美化环境。

作为养殖渔业，该模式被许多渔业产业化龙头企业运用。按照国家制定的有关标准和要求，该模式生产的出来的水产品大都属于绿色水产品和有机蔬菜，它突出的是产品品质和特性，都是地理标志产品特点，是水产品中的珍品，获得消费者青睐，而且还能给生产者带来大的回报。新型室内高密度养鱼该类企业实施的品牌发展战略，它按照公司+渔农户这一产业化模式组织生产，为辐射带动更多的渔农户发展鱼菜共生，它们先在其养殖基地办点示范，诸如优选场地，室内高密度养鱼系统营造生产设施，优选养殖鱼类和栽培蔬菜品种，制定养殖技术标准和生产流程，在经济效益导向下，许多渔农户也尝试运用该模式发展渔业和蔬菜生产。目前，该类模式占60%。

1、持续高的效率。鱼菜共生系统始终处于运转过程中，生产过程不会中断，所以系统会源源不断地生产鱼和蔬菜。同时，兼有生态饮食服务，科普宣传活动，是一种高的效率的生产模式。所以鱼不仅不会吃掉菜，反而会更高的效率；新型室内高密度养鱼2、节约能源；3、高品质产出。通过对鱼菜共生系统产出能力的分析，可以看到在鱼菜共生系统的整个生产过程中，不需要使用一点肥料与农药，鱼和菜的生长是依赖系统中不断流动的水。室内高密度养鱼系统通过微生物的作用保证鱼和菜的高品质。在追求食品安全与绿色 GDP 的现代社会，这种可以自给自足的系统，的确是一种非常值得大力推广的可持续发展生产模式。