鱼菜共生的基本原理是水产养殖的水经过初步过滤后，被输送到植物栽培系统，由栽培系统中的硝化细菌将水中的氨氮分解及亚硝酸盐分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。新型温室连栋大棚而植物根系又有很强的吸收和过滤能力，水流过植物栽培系统后就相当于经过了净化，再流回水产养殖系统，这样形成一个共生的循环，只用向水产养殖系统定期定量投放饲料，温室连栋大棚系统定期补充蒸发消耗的水分，整改系统就能长期稳定的运行下去，从而实现“种菜不施肥，养鱼不换水”，种养健康无公害。

国内专注鱼菜共生领域的农业公司还不多。很多农场只是把鱼菜共生作为三产概念引入农场，并没有实际采用鱼菜共生技术进行大规模栽培和向市场供应蔬菜和水产。新型温室连栋大棚耕作体系模式:1、闭锁循环模式:养殖池排放的水经由硝化床微生物处理后，以循环的方式进入蔬菜栽培系统，经由蔬菜根系的生物吸收过滤后，又把处理后的废水返回至养殖池，形成一个闭路循环。温室连栋大棚系统2、开环模式:由养殖池排放的废水作为一次性灌溉用水直接供应蔬菜种植系统而不形成返还回流，每次只对养殖池补充新水。在水源充足的地方可以采用该模式。

水肥一体化就是先将肥料兑水溶解，再加入管道灌溉系统，在灌溉的同时将肥料输送到作物根部，适时适量满足作物水肥需求的一种现代农业新技术。新型温室连栋大棚通俗地讲，水肥一体化就是作物的根在哪里，就将管道通到哪里，水和肥就送到哪里。水肥一体化实现了七个转变：渠道输水向管道输水转变；被动灌溉向主动灌溉转变；温室连栋大棚系统浇地向浇庄稼转变；土壤施肥向作物施肥转变；水肥分开向水肥一体转变；单一管理向综合管理转变；传统农业向现代农业转变。有专家指出：水肥一体化是发展现代农业的重大技术，更是建设资源节约、环境友好现代农业的“一号技术”，堪称“农业生产方式的革命”。

现代渔业是由捕捞、养殖、加工与增殖、休闲五大细分产业构成，其中休闲渔业是由休闲垂钓、观赏性养殖和导向性旅游组成，它是渔业的高业态，新型温室连栋大棚是渔业发展的增长点和渔农增收点，而种植型养殖模式除了渔业生产功能之外还具有资源增殖和环境再造等价值，其高点是鱼菜共生，温室连栋大棚系统这就让休闲渔业龙头企业、专业户和爱好者在营造垂钓场、观赏鱼养殖场和休闲渔业主题公园时运用了鱼菜共生这一模式发展休闲渔业，例如家居搞人工造景，营造微型生态，公园搞生态种养，绿化、美化环境。