氮素主要以硝酸盐的形式供应给水培植物，通过细菌硝化作用从鱼类废物的氨转化而来。 其他一些营养物质溶解在鱼废弃物中的水中，但大多数营养物质仍处于植物无法获得的固态。 固体鱼废物被异养细菌分解; 这一行动将必需的营养物质释放到水中。 新型植物工厂确保植物不遭受缺陷的好方法是保持好的水体pH值（6-7）并为鱼类提供平衡和完整的食物，并利用饲料比率来平衡鱼类对植物的摄食量。植物工厂技术然而，随着时间的推移，即使是平衡的水培养系统也可能缺乏某些营养素，常见的是铁钾或钙。这些营养素的缺乏是鱼饲料成分的结果。

鱼菜共生是一种新型的复合耕作体系，它把水产养殖与水耕栽培这两种原本都不同的农耕技术，通过巧妙的生态设计，达到科学的协同共生，从而实现养鱼不换水而无水质忧患，种菜不施肥而正常成长的生态共生效应。新型植物工厂在传统的水产养殖中，随着鱼的排泄物积累，水体的氨氮增加，毒性逐步增大。而在鱼菜共生系统中，水产养殖的水被输送到水培栽培系统，由细菌将水中的氨氮分解成亚硝酸盐然后被硝化细菌分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。植物工厂技术鱼菜共生让动物、植物、微生物三者之间达到一种和谐的生态平衡关系，是可持续循环型零排放的低碳生产模式，也是有效解决农业生态危机的有效方法。

温室大棚内光照环境包括室内光照分布均匀性、光照强度、光照时数及光质等。在温室大棚规划、设计及室内设备的布置过程中要注意保证室内光照分布的均匀性。一般来讲，温室大棚主要靠自然采光，因此温室大棚一般采用透光性能高的覆盖材料，保证室内获得足够的光照度。新型植物工厂有时温室大棚也配置补光系统和遮光设备，调 节室内光照强度和光周期，满足作物栽培需要。植物工厂技术温室大棚覆盖材料的性质往往影响室内光照的光谱特性，有些情况下需要采用特殊的覆盖材料或补光设备改变室内光质。

在政策层面上，各级政府渔业主管部门都将该模式作为渔业发展新的增长点和渔农增收点培育，以财政专项资金扶持一批渔业产业化龙头企业，让它们结合自己的生产经营开展该模式的研发、试验和示范，总结产品标准，推广养殖技术和操作规范，以品牌为先导，运用公司+渔农户这一产业化模式带动更多的渔农群众户发展鱼菜共生。新型植物工厂在商言商，要让鱼菜共生这一生态综合种养模式到处落地生根、开花结果，就需要政府尤其是渔业主管部门、水产技术推广机构，按照一主多元模式，植物工厂技术将科研单位、大专院校、行业协会、专业合作经济组织的力量聚焦在渔业产业化龙头上，同时吸引社会力量参与该模式的推广。

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