1.合理选择饲养池。鱼池是鱼菜共生的重要组成部分之一。2.良好的通风和循环水。这套系统需要使用水泵，要保持水体在种植和养殖两个部分间保持循环流动，从而确保水体洁净、细菌成活和植物健康生长。3.严格管控水质。水是鱼菜共生系统的“生命源泉”。新型水肥一体化它既是植物吸收营养物质的媒介，又是鱼类生存的基本条件。4.严格养殖密度。建议水产养殖箱中鱼类的放养密度每立方水体不超过20千克。水肥一体化系统5.严格饲喂量。要根据鱼的养殖量进行定时定量投喂，并且投喂30分钟后及时清理饲料残渣，根据饲喂情况对隔天的投喂量作出相应调整。 6.合理规划植物种植种类和间距。

国内专注鱼菜共生领域的农业公司还不多。很多农场只是把鱼菜共生作为三产概念引入农场，并没有实际采用鱼菜共生技术进行大规模栽培和向市场供应蔬菜和水产。新型水肥一体化耕作体系模式:1、闭锁循环模式:养殖池排放的水经由硝化床微生物处理后，以循环的方式进入蔬菜栽培系统，经由蔬菜根系的生物吸收过滤后，又把处理后的废水返回至养殖池，形成一个闭路循环。水肥一体化系统2、开环模式:由养殖池排放的废水作为一次性灌溉用水直接供应蔬菜种植系统而不形成返还回流，每次只对养殖池补充新水。在水源充足的地方可以采用该模式。

养鱼和种菜原本是两项分离的农业技术，可能受到了“稻花鱼”（稻田养鱼）的启示，逐渐将两项技术融合为一。形成了鱼和菜共同促成的效果，同时更重要的是，它是一项综合效益很高的纯有机耕作模式——“种菜不施肥，养鱼不换水”。新型水肥一体化前国内专门从事鱼菜共生研究和市场开发的公司还不多，其实鱼菜共生是一项涉及到微生物、植物、鱼三者共营共生的技术，水肥一体化系统利用三者间的生态关系实现能量物质间的可循环可持续动态发展，达到一种仿自然生态而胜于自然的生态的人工系统，主要的是要考虑这样一个系统的平衡。

水肥一体化就是先将肥料兑水溶解，再加入管道灌溉系统，在灌溉的同时将肥料输送到作物根部，适时适量满足作物水肥需求的一种现代农业新技术。新型水肥一体化通俗地讲，水肥一体化就是作物的根在哪里，就将管道通到哪里，水和肥就送到哪里。水肥一体化实现了七个转变：渠道输水向管道输水转变；被动灌溉向主动灌溉转变；水肥一体化系统浇地向浇庄稼转变；土壤施肥向作物施肥转变；水肥分开向水肥一体转变；单一管理向综合管理转变；传统农业向现代农业转变。有专家指出：水肥一体化是发展现代农业的重大技术，更是建设资源节约、环境友好现代农业的“一号技术”，堪称“农业生产方式的革命”。