在栽培部分，主要的技术模式有以下几种:1、基质栽培:蔬菜种植在如砾石或者陶粒等基质中。基质起到生化过滤和固态肥料过滤的作用。硝化细菌生长在基质表面，具体负责生化过滤和固态肥料过滤。这种方式适合种植各类蔬菜。2、深水浮筏栽培:蔬菜种植于水槽上，通过泡沫等漂浮材料将其托起。蔬菜的根向下通过浮筏的孔延伸到水中吸收养分。新型植物工厂这种方式比较适用于叶类蔬菜。3、营养膜管道栽培: 通常采用PVC管作为种植载体，营养丰富的水被抽到PVC管道中。植物工厂技术植物通过定植篮的固定，种植于PVC管道上方的开口内，让自己的根访问水分和吸收营养。这种方式主要用于叶类蔬菜。4、气雾栽培:直接将养鱼的水雾化后喷洒到植物的根系，以达到营养吸收的目的。这种方式也主要用于叶类蔬菜，在喷雾之前需要对水进行充分过滤净化，以免堵塞喷雾装置。

它有别于传统的水产养殖，不存在水污染，所以不需要经常大范围地换水。系统本身是一个闭环的生产系统，系统中的水除了蒸发之外，不存在别的耗损情况。又因为水在整个系统中形成了自循环，不需要一直更换水，水的利用率达到了 90%以上。新型植物工厂养鱼池在大棚中，白天水池可以蓄积来自太阳光的能量，晚间释放出来。所以，鱼菜共生大棚中，白天比普通大棚凉爽，晚上又比普通大棚温暖，形成了一个微型的海洋性气候，节约大量加温大棚所需的能源，节约了大量电力消耗。植物工厂技术鱼菜共生系统的建立，可以大大缓解用地困境，因为整个的生产过程对土地的依赖非常小，不需要占用过多的土地，节约用地，同时，也可以避免很多的土生病。因此，鱼菜共生系统是一个节水、节电和节约土地的生产系统。

养鱼和种菜原本是两项分离的农业技术，可能受到了“稻花鱼”（稻田养鱼）的启示，逐渐将两项技术融合为一。形成了鱼和菜共同促成的效果，同时更重要的是，它是一项综合效益很高的纯有机耕作模式——“种菜不施肥，养鱼不换水”。新型植物工厂前国内专门从事鱼菜共生研究和市场开发的公司还不多，其实鱼菜共生是一项涉及到微生物、植物、鱼三者共营共生的技术，植物工厂技术利用三者间的生态关系实现能量物质间的可循环可持续动态发展，达到一种仿自然生态而胜于自然的生态的人工系统，主要的是要考虑这样一个系统的平衡。

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