目前，一般高密度产业化水产养殖，主要依靠物理与化学净化水质的方法，但设备与运作的成本较高，难以让普通业主所接受，存在的养殖成本高，市场竞争力弱的问题，而引进植物与微生物参予系统共建时，就可以发挥微生物的强大分解能力来处理分解水中的有机物及转化对鱼生存影响较大的氨氮，新型水培蔬菜大棚可以啟动植物庞大的根系表面积来吸收吸附分解后可利用吸收的矿物质，从而达到水中残留物及有害物的及时转化与生物净化，水培蔬菜大棚系统为鱼的高密度养殖提供可循环利用的水资源，达到节水节能节料的目的。

要想自己的鱼菜共生蓬勃发展，请遵循以下三个规则：不要忽视虫子，保持鱼缸健康，保持高质量的水。尽管水培作物不太可能遭受害虫侵害，但它们对于蚜虫，红蜘蛛和苍蝇是一个例外，有的种植户还专门从苗圃购买幼苗。在某些情况下，有害昆虫甚至可以作为额外蛋白质的来源直接喂给鱼。新型水培蔬菜大棚也有各种各样的有机和化学喷雾剂，它们也可以消除鱼菜共生系统中的有害虫子。炎热的夏季会导致水温飙升，失去pH值并可能危害鱼类。空调或风扇可以帮助维持鱼类所需的温度。水培蔬菜大棚系统水生植物种植者还须平衡鱼与植物的比例，因为太多的鱼会导致鱼和植物活不下去。其次，鱼缸应始终易于取用。养殖者通常在鱼缸顶部安装生长床以节省空间，但这会使观察鱼缸内部的状况，换水和捕捞鱼变得困难。确保鱼缸和生长通道的布局合理，便于定期观察鱼并与鱼互动。

养鱼和种菜原本是两项分离的农业技术，可能受到了“稻花鱼”（稻田养鱼）的启示，逐渐将两项技术融合为一。形成了鱼和菜共同促成的效果，同时更重要的是，它是一项综合效益很高的纯有机耕作模式——“种菜不施肥，养鱼不换水”。新型水培蔬菜大棚前国内专门从事鱼菜共生研究和市场开发的公司还不多，其实鱼菜共生是一项涉及到微生物、植物、鱼三者共营共生的技术，水培蔬菜大棚系统利用三者间的生态关系实现能量物质间的可循环可持续动态发展，达到一种仿自然生态而胜于自然的生态的人工系统，主要的是要考虑这样一个系统的平衡。

氮素主要以硝酸盐的形式供应给水培植物，通过细菌硝化作用从鱼类废物的氨转化而来。 其他一些营养物质溶解在鱼废弃物中的水中，但大多数营养物质仍处于植物无法获得的固态。 固体鱼废物被异养细菌分解; 这一行动将必需的营养物质释放到水中。 新型水培蔬菜大棚确保植物不遭受缺陷的好方法是保持好的水体pH值（6-7）并为鱼类提供平衡和完整的食物，并利用饲料比率来平衡鱼类对植物的摄食量。水培蔬菜大棚系统然而，随着时间的推移，即使是平衡的水培养系统也可能缺乏某些营养素，常见的是铁钾或钙。这些营养素的缺乏是鱼饲料成分的结果。