鱼菜共生的基本原理是水产养殖的水经过初步过滤后，被输送到植物栽培系统，由栽培系统中的硝化细菌将水中的氨氮分解及亚硝酸盐分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。新型蔬菜水培而植物根系又有很强的吸收和过滤能力，水流过植物栽培系统后就相当于经过了净化，再流回水产养殖系统，这样形成一个共生的循环，只用向水产养殖系统定期定量投放饲料，蔬菜水培技术定期补充蒸发消耗的水分，整改系统就能长期稳定的运行下去，从而实现“种菜不施肥，养鱼不换水”，种养健康无公害。

鱼菜共生就是让动物、植物、微生物三者之间达到一种和谐的生态平衡关系，鱼菜共生的出现给那些无法获得耕地和水的人来说那就是雪中送炭。新型蔬菜水培鱼菜共生系统经济价值非常高。鱼菜共生中的水被回收，哪怕在干旱季节也可以生产农作物，使用鱼菜共生模式有很多令人兴奋的好处，例如提高用水效率，无需土壤，生长更快和降低病虫害。蔬菜水培技术鱼菜共生不受自然环境的侵蚀，所以是一项可以长期经营的事业，还可以提高生长空间和利润，无论种植者身在何处，高产量和低运营成本的结合都是使利益大化的秘诀。

蔬菜根系未与土壤相接触。而且采用智能化调控温、光、水和二氧化碳，设置隔离带防止病虫侵入，能避免土壤连作障碍、天气灾害和病虫害，新型蔬菜水培也无重金属污染，无需打农药，保证了蔬菜品质和清洁卫生，不用洗就可随摘随吃，并能做到全天候生产，每日播种和每日收获，这样做能很好地解决蔬菜淡季供应的问题。蔬菜水培技术由于蔬菜“种”在水里，自动供给营养，省去了耕地、施肥、除草的人工成本，“这在目前人工成本较高的地区有优势。”内业人士指出，“水培对环境和营养的可控性高，可实现高产高质。”

鱼菜共生有三种不同的养殖模式：深水养殖（DWC），营养膜技术（NFT）和培养基床。在DWC系统中，将农作物种植在漂浮在富含营养的水之上的泡沫筏中，并在固体废物到达植物之前将其过滤掉。新型蔬菜水培使用NFT，缓慢移动的水会汇入狭窄的通道，然后循环回到鱼缸。过滤设备用于清理生物废物中的水，然后将其再循环。蔬菜水培技术DWC和NFT通常在商业环境中使用。培养基床只是装满多孔岩石（通常是粘土颗粒）的容器，鱼缸中的水被泵入容器中。可以连续抽水，也可以通过注满水和排干容器来抽水。泄洪方法（也称为潮起潮落）易于维护。

水肥一体化就是先将肥料兑水溶解，再加入管道灌溉系统，在灌溉的同时将肥料输送到作物根部，适时适量满足作物水肥需求的一种现代农业新技术。新型蔬菜水培通俗地讲，水肥一体化就是作物的根在哪里，就将管道通到哪里，水和肥就送到哪里。水肥一体化实现了七个转变：渠道输水向管道输水转变；被动灌溉向主动灌溉转变；蔬菜水培技术浇地向浇庄稼转变；土壤施肥向作物施肥转变；水肥分开向水肥一体转变；单一管理向综合管理转变；传统农业向现代农业转变。有专家指出：水肥一体化是发展现代农业的重大技术，更是建设资源节约、环境友好现代农业的“一号技术”，堪称“农业生产方式的革命”。