不健康的鱼类或植物通常会表示鱼菜共生系统失去平衡。植物缺陷的症状通常表明没有足够的鱼类废物产生营养。营养缺乏症通常表现为生长不良，叶片发黄，根部发育不良，所有这些都在第6章中讨论。在这种情况下，鱼的放养密度，饲料（如果被鱼吃掉）和生物过滤器可以增加，或者植物可以除去。同样，如果鱼类表现出压力的迹象，例如在表面喘气，在罐体侧面摩擦，或者在鱼鳍，眼睛和鳃周围显示红色区域，或者在情况下死亡，通常是因为堆积有毒的氨或亚硝酸盐水平。当生物过滤器处理的溶解废物太多时，通常会发生这种情况。鱼或植物中的任何这些症状都表明农民需要积调查并纠正原因。

氮测试

这种方法涉及使用简单和便宜的水质检测试剂盒检测水中的氮含量（图2.14）。如果氨或亚硝酸盐含量过高（>1毫克/升），则表明生物过滤不充分，应提高生物滤池表面积。大多数鱼不能忍受这么高水平超过几天。需要增加硝酸盐的含量，并且意味着植物生长所需的其他营养物质的足够水平。鱼可以忍受硝酸盐含量升高，但如果水平保持在高水平（>150毫克/升）数周，则应去除一些水并用于灌溉其他作物。如果在几周的时间内硝酸盐含量很低（<10毫克），可以稍微增加鱼饲料以确保蔬菜有足够的营养。但是，不要在水产养殖池中留下未吃完的鱼饲料，因此增加鱼放养鱼的密度可能是需要的。或者移除植物，以便有剩余的营养物质。